L’association Eglise adventiste du 7ème jour au Pays de Gex est administrée par un comité d’église composé :
- d’un/e président/e,
- d’un/e secrétaire, d’un/e trésorier/e et d’au moins quatre autres membres.
Les membres du comité sont élus pour un mandat d'un ou deux ans, selon décision de l’assemblée générale. Les membres sortants sont rééligibles.
Le président est nommé par l’assemblée générale sur proposition du conseil d’administration de la Fédération.

Le président actuel est Nuvind SEENUNDUN, pasteur de la communauté.

Les comités se réunissent chaque mois.